DG – Director Geral
DGA – Director Geral Adjunto
SCLS – Serviços Centrais de Licenciamento Sanitário
DLSUPO – Departamento de Licenciamento Sanitário de Unidades Produtivas e Operadores
DLSIA – Departamento de Licenciamento Sanitário de Instalações de AquaculturaSCCSQ – Serviços Centrais de Certificação Sanitária e Quarentena
DCSM – Departamento de Controlo Sanitário para o Mercado
DVSQ – Departamento de Vigilância Sanitária e QuarentenaSCL – Serviços Centrais de Laboratórios
DAL – Departamento de Análises LaboratoriaisDGQ – Departamento de Gestão de Qualidade
RGQL – Repartição de Gestão de Qualidade de LaboratóriosRGQSIP – Repartição de Gestão de Qualidade do Sistema de Inspecção do PescadoGJ – Gabinete JurídicoDACI – Departamento de Auditoria e Controlo InternoRICO – Repartição de Inspecção aos Controlos Oficiais
RAAF – Repartição de Auditoria Administrativa FinanceiraDARH – Departamento de Administração e Recursos Humanos
RAFP – Repartição de Administração, Finanças e Património
RRH – Repartição de Recursos HumanosDPE – Departamento de Planificação e Estatística
RTIC – Repartição de Tecnologias de Informação e ComunicaçãoRA – Repartição de AquisiçõesSG – Secretaria Geral